Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tnp1P10856 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms