Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl2P10148 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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