Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TtrP07309 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms