Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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H2-Eb1P04230 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-Eb1P04230 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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