Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P04214 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P04214 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P04214 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P04214 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms