Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01812 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01812 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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