Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01747 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01747 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms