Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P01672 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P01672 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01672 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01672 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01672 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P01672 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P01672 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms