Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CopeO89079 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CopeO89079 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CopeO89079 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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