Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cops6O88545 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cops6O88545 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cops6O88545 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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