Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lnx1O70263 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms