Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TsksO54887 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TsksO54887 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TsksO54887 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TsksO54887 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms