Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DffaO54786 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DffaO54786 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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