Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2172.6 ms