Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ColqO35348 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ColqO35348 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms