Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Degs1O09005 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms