Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3aO08665 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms