Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MttpO08601 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
MttpO08601 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms