Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp35M0QWN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms