Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3542K7N6U2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3542K7N6U2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm3542K7N6U2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3542K7N6U2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms