Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21310J3QQ23 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21310J3QQ23 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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