Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm2056J3QQ02 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms