Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm5849J3QPE5 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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