Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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