Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm2035J3QP87 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms