Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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E030018B13RikJ3QMS9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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E030018B13RikJ3QMS9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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E030018B13RikJ3QMS9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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E030018B13RikJ3QMS9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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