Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20825J3QM67 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms