Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms