Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21411J3KMS0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms