Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20828J3KMI7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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