Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp32F8VPZ3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms