Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm10378F6XQQ1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms