Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17669F6QL70 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms