Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Myo5cE9Q1F5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Myo5cE9Q1F5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms