Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20425E9Q035 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20425E9Q035 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms