Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc175E9PVB3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms