Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms