Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tgfbr3lD3YZZ2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms