Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc6D3YZP9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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