Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Phf11bB4XVQ1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Phf11bB4XVQ1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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