Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clrn2B2RVW2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clrn2B2RVW2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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