Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apba1B2RUJ5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apba1B2RUJ5 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms