Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prrt4B2RU40 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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