Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp42B2RQC2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp42B2RQC2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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