Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms