Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms