Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem235B1AQL3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms