Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prr16A3KMN5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prr16A3KMN5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms