Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Samt1A2BED8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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