Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtf1A2AQ19 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rtf1A2AQ19 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtf1A2AQ19 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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